Труды Кубанского государственного аграрного университета


<<<  Назад

2021 год, № 88

УДК: 632.7:575.116.4
ГРНТИ: 68.37.29, 34.15.23

СОЗДАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНЫХ МАРКЕРОВ С ЦЕЛЬЮ ИДЕНТИФИКАЦИИ ВЫСШИХ ТАКСОНОМИЧЕСКИХ РАНГОВ НАСЕКОМЫХ (INSECTA), ОБИТАЮЩИХ В АГРОЦЕНОЗАХ КРАСНОДАРСКОГО КРАЯ

Описано конструирование молекулярных праймерных пар для 4 отрядов и 24 семейств широко распространенных в агроценозах Краснодарского края насекомых на основе 18S rRNA и 28S rRNA.
Ключевые слова: ДНК, ПЦР, праймеры, высшие таксоны насекомых, вредители сельского хозяйства, энтомофаги, хищники, содержимое кишечника, Краснодарский край.
DOI: 10.21515/1999-1703-88-111-119

Литература:

  1. Китаев, К. А. Молекулярно-генетические методы анализа хищничества среди насекомых в агроценозах / К. А. Китаев, М. Б. Удалов, Г. В. Беньковская // Экологическая генетика. - 2011 - T. 9 (4). - C. 15-24.
  2. Хомицкий, Е. Е. Создание и тестирование in silico молекулярных маркеров с целью идентификации 16 видов насекомых-вредителей сельского хозяйства в Краснодарском крае / Е. Е. Хомицкий, А. С. Замотайлов, Д. С. Савенкова, А. В. Милованов, А. И. Белый // Труды Кубанского государственного аграрного университета. - 2019. - Вып. 5 (80). - С. 200-208. - https://doi.org/:10.21515/1999-1703-80-200-208.
  3. Campbell, B. C. Evolutionary origin of whiteflies (Hemiptera: Sternorrhyncha: Aleyrodidae) inferred from 18S rDNA sequences / B. C. Campbell, J. D. Steffen, B. C. Campbell, R. J. Gill // Insect molecular biology. - 1994. - Vol. 3. - No 2. - P. 73-88. - https://doi.org/10.1111/j.1365-2583.1994. tb00154.x.
  4. Frati, F. Evolution of the mitochondrial cytochrome oxidase II gene in Collembola / F. Frati, C. Simon, J. Sullivan, D.L. Swofford // Journal of Molecular Evolution. - 1997. - Vol. 44. - No 2. - P. 145-158. - https://doi.org/10.1007/ PL00006131.
  5. Geer, L. Y. The NCBI biosystems database / L. Y. Geer, A. Marchler-Bauer, R. C. Geer, L. Han, J. He, S. He, C. Liu, W. Shi, S.H. Bryant // Nucleic acids research. - 2010. - Vol. 38. - Suppl. 1. - P. D492-D496. - https://doi.org/10.1093/nar/ gkp858.
  6. Golub, N. V. New data on karyotypes of lace bugs (Tingidae, Cimicomorpha, Hemiptera) with analysis of the 18S rDNA clusters distribution / N. V. Golub, V. B. Golub, V. G. Kuznetsova // Comparative Cytogenetics. - 2018. - Vol. 12. - No 4. - P. 515. - https://doi.org/10.3897/Comp Cytogen.v12i4.30431.
  7. Kibbe, W. A. OligoCalc: an online oligonucleotide properties calculator // Nucleic acids research. - 2007. - Vol. 35. - Suppl. 2. - P. W43 - W46. - https://doi.org/10.1093/nar/gkm234.
  8. Mioduchowska, M. Instances of erroneous DNA barcoding of metazoan invertebrates: Are universal cox1 gene primers too "universal"? / M. Mioduchowska, M. J. Czyż, B. Gołdyn, J. Kur, J. Sell // PLoS One. - 2018. - Vol. 13. - No 6. - P. e0199609. - https://doi.org/10.1371/journal.pone. 0199609.
  9. Untergasser, A. Primer3 - new capabilities and interfaces / A. Untergasser, I. Cutcutache, T. Koressaar, J. Ye, B. C. Faircloth, M. Remm, S. G. Rozen // Nucleic acids research. - 2012. - Vol. 40. - No 15. - P. e115. - https://doi.org/10.1093/ nar/gks596.

Авторы:

  1. Хомицкий Евгений Евгеньевич, аспирант, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина».
  2. Замотайлов Александр Сергеевич, д-р биол. наук, профессор, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина».
  3. Савенкова Дарья Сергеевна, студент, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина».
  4. Милованов Александр Валериевич, канд. биол. наук, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина».
  5. Белый Александр Иванович, канд. с.-х. наук, доцент, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина».