Труды Кубанского государственного аграрного университета


<<<  Назад

2023 год, № 107

УДК: 636.4.033
ГРНТИ: 68.39.35, 34.23.35, 34.23.37, 68.03.05

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ СРЕДНЕСУТОЧНОГО ПРИРОСТА И КОНВЕРСИИ КОРМА ТОВАРНЫХ ПОМЕСЕЙ В СВИНОВОДСТВЕ

В настоящее время выявление генетической компоненты хозяйственно-полезных признаков животных для дальнейшего формирования оптимальной селекционной работы является актуальной задачей в животноводстве. Цель нашей работы - проведение анализа генетических показателей кормового поведения товарных гибридов свиней. Для решения поставленной цели использовался метод полногеномного анализа (GWAS), позволяющий обнаружить ассоциативный ряд однонуклеотидных полиморфизмов. В нашей работе GWAS был проведен для оценок племенной ценности (EBV). В итоге были выявлены наиболее функционально интересные гены-кандидаты, которые могут влиять на среднесуточный прирост и конверсию корма свиней.
Ключевые слова: Полногеномное ассоциативное исследование, SNP, среднесуточный прирост, конверсия корма, помеси второго поколения (F2), свиньи.
DOI: 10.21515/1999-1703-107-278-287

Литература:

  1. Ding, R. Genetic Architecture of Feeding Behavior and Feed Efficiency in a Duroc Pig Population / R. Ding, M. Yang, X. Wang, J. Quan, Z. Zhuang, S. Zhou, S. Li, Z. Xu, E. Zheng, G. Cai, D. Liu, W. Huang, J. Yang, Z. Wu // Frontiers in genetics. - 2018. - Vol. 9. - P. 220.
  2. Nonneman, D. J. Genome-wide association and identification of candidate genes for age at puberty in swine / D. J. Nonneman, J. F. Schneider, C. A. Lents, R. T. Wiedmann, J. L. Vallet, G. A. Rohrer // BMC genetics. - 2016 - Vol. 17. - P. 50.
  3. Do, D. N. Genetic parameters for different measures of feed efficiency and related traits in boars of three pig breeds / D. N. Do, A. B. Strathe, J. Jensen, T. Mark, H. N. Kadarmideen // Journal of animal science. - 2013. - Vol. 91 - Issue 9. - P. 4069-4079.
  4. Wells, K. D. Genome-editing technologies to improve research, reproduction, and production in pigs / K. D. Wells, R. S. Prather // Molecular reproduction and development. - 2017. - Vol. 84. - Issue 9. - P. 1012-1017.
  5. Schinckel, A. P. Daily feed intake, energy intake, growth rate and measures of dietary energy efficiency of pigs from four sire lines fed diets with high or low metabolizable and net energy concentrations / A. P. Schinckel, M. E. Einstein, S. Jungst, J. O. Matthews, C. Booher, T. Dreadin, C. Fralick, E. Wilson, R. D. Boyd // Asian-Australasian journal of animal sciences. - 2012. - Vol. 25. - Issue 3. - P. 410-420.
  6. Wang, J. S. Effects of first feed intake time on growth performance, nutrient apparent metabolic rate and intestinal digestive enzyme activities in broilers /j. S. Wang, T. Y. Guo, Y. X. Wang, K. X. Li, Q. Wang, X. A. Zhan // Asian-Australasian journal of animal sciences. - 2018. - Vol. 31. - Issue 6. - P. 899-904.
  7. Li, X. Whole-genome sequencing identifies potential candidate genes for reproductive traits in pigs/ X. Li, J. Ye, X. Han, R. Qiao, X. Li, G. Lv, K. Wang // Genomics. - 2020. - Vol. 112. - Issue 1. - P. 199-206.
  8. Baumung, R. Feed intake behavior of different pig breeds during performance testing on station / R. Baumung, G. Lercher, A. Willam, J. Sölkner // Archiv fur Tierzucht, Dummerstorf. - 2006. - Vol. 49. - Issue 1. - P. 77-88.
  9. Maselyne, J. Review: Quantifying animal feeding behaviour with a focus on pigs /j. Maselyne, W. Saeys, A. Van Nuffel // Physiology & behavior. - 2015. - Vol. 138. - P. 37-51.
  10. Wenk, C. Energetic aspects of feed conversion in growing pigs/ C. Wenk, H. P. Pfirter, H. Bickel // Livestock Production Sciencs. - 1980. - Vol.7 - P. 483-495.
  11. Jiao, S. Feed intake, average daily gain, feed efficiency, and real-time ultrasound traits in Duroc pigs: II. Genomewide association / S. Jiao, C. Maltecca, K.A. Gray, J.P. Cassady // Journal of animal science. - 2014. - Vol. 92. - Issue 7. - P. 2846-2860.
  12. Hall, A. D. Genetic and phenotypic parameter estimates for feeding pattern and performance test traits in pigs / A. D. Hall, W. G. Hill, P. R. Bampton, A. J. Webb // Animal Science. - 1999. - Vol. 68 - P. 43-48.
  13. Lee, K. T. Neuronal genes for subcutaneous fat thickness in human and pig are identified by local genomic sequencing and combined SNP association study / K. T. Lee, M. J. Byun, K. S. Kang, E. W. Park, S. H. Lee, S. Cho, H. Kim, K. W. Kim, T. Lee, J. E. Park, W. Park, D. Shin, H. S. Park, J. T. Jeon, B. H. Choi, G. W. Jang, S. H. Choi, D. W. Kim, D. Lim, H. S. Park, M. R. Park, J. Ott, L.B. Schook, T. H. Kim, H. Kim // PLoS One. - 2011. - Vol. 6. - Issue 2. - e16356.
  14. Young, R. J. Feeding behaviour of pigs in groups monitored by a computerized feeding system / R. J. Young, A. B. Lawrence // Anim. Prod. - 1994. - Vol. 58. - P. 145-152.
  15. Белоус, А. А. Генетические и паратипические факторы, характеризующие эффективность использования корма у свиней породы дюрок / А. А. Белоус, А. А. Сермягин, О. В. Костюнина, Е. А. Требунских, Н. А. Зиновьева // Сельскохозяйственная биология. - 2018. - Том 53. - № 4. - С. 712-722.
  16. Wang, X. Genome-Wide CRISPR/Cas9 Screen Reveals a Role for SLC35A1 in the Adsorption of Porcine Deltacoronavirus / X. Wang, Q. Jin, W. Xiao, P. Fang, L. Lai, S. Xiao, K. Wang, L Fang // Journal of Virology. - 2022. - Vol. 96. - №24.
  17. Kauskot, A. A mutation in the gene coding for the sialic acid transporter SLC35A1 is required for platelet life span but not proplatelet formation / A. Kauskot, T. Pascreau, F. Adam, A. Bruneel, C. Reperant, M. D. Lourenco-Rodrigues, J. P. Rosa, R. Petermann, H. Maurey, C. Auditeau, D. Lasne, C.V. Denis, M. Bryckaert, P. de Lonlay, C. Lavenu-Bombled, J. Melki, D. Borgel // Haematologica. - 2018. - Vol. 103. - Issue 12. - P. 613-617.
  18. Kolosov, A. Investigation of the Genetic Architecture of Pigs Subjected to Breeding Intensification / A. Kolosov, L. Getmantseva, M. Kolosova, T. Romanets, N. Bakoev, E. Romanets, I. Bakoeva, O. Kostyunina, Y. Prytkov, O. Tretiakova, S. Bakoev // Genes. - Vol. 13. - № 2. - P. 197.
  19. Cerrone, M. Plakophilin-2 is required for transcription of genes that control calcium cycling and cardiac rhythm / M. Cerrone, J. Montnach, X. Lin, Y.T. Zhao, M. Zhang, E. Agullo-Pascual, A. Leo-Macias, F. J. Alvarado, I. Dolgalev, T. V. Karathanos, K. Malkani, C. J. M. Van Opbergen, J. J. A. van Bavel, H. Q. Yang, C. Vasquez, D. Tester, S. Fowler, F. Liang, E. Rothenberg, A. Heguy, G. E. Morley, W. A. Coetzee, N. A. Trayanova, M. J. Ackerman, T. A. B. van Veen, H. H. Valdivia, M. Delmar // Nat Commun. - 2017. - Vol. 8. - Issue 1. - P. 106.
  20. Velez-Irizarry, D. Genetic control of longissimus dorsi muscle gene expression variation and joint analysis with phenotypic quantitative trait loci in pigs / D. Velez-Irizarry, S. Casiro, K. R. Daza // BMC Genomics. - 2019. - Vol. 20. - P. 3.
  21. Han, X. Identification of Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase Gene as an Alternative Safe Harbor Locus in Pig Genome / X. Han, Y. Xiong, C. Zhao, S. Xie, C. Li, X. Li, X. Liu, K. Li, S. Zhao, J.Ruan // Genes. - 2019. - Vol. 10. - Issue 9. - P. 660.
  22. Dashwood, M. R. Endothelin-1 as a neuropeptide: neurotransmitter or neurovascular effects? / M. R. Dashwood, A. Loesch //j. Cell Commun. Signal. - 2009. - Vol. 4. - P. 51-62.
  23. Khimji, A. K. Endothelin-biology and disease / A. K. Khimji, D. C. Rockey // Cell. Signal. - 2010. - Vol. 22. - P. 1615-1625.
  24. Hans, G. Nociceptive sensitization by endothelin-1 / G. Hans, B.L. Schmidt, G. Strichartz // Brain Res. Rev. - 2009. - Vol. 60. - P. 36-42.
  25. Abman, S. H. Role of endothelin receptor antagonists in the treatment of pulmonary arterial hypertension / S. H. Abman // Annu. Rev. Med. - 2009. - Vol. 60. - P. 13-23.
  26. Kohan, D. E. Biology of endothelin receptors in the collecting duct / D. E. Kohan // Kidney Intl. - 2009. - Vol. 76. - P. 481-486.
  27. Ramos-Casals, M. Targeted therapy for systemic sclerosis: how close are we? / M. Ramos-Casals, V. Fonollosa-Pla, P. Brito-Zeron, A. Siso-Almirall // Nat. Rev. Rheumatol. - 2010. - Vol. 6. - P. 269-278.
  28. Bagnato, A. The endothelin axis in cancer: the promise and the challenges of molecularly targeted therapy / A. Bagnato, F. Spinella, L. Rosano // Can. J. Physiol. Pharmacol. - 2008. - Vol. 86. - P. 473-484.
  29. Kurihara, Y. (1994) Elevated blood pressure and craniofacial abnormalities in mice deficient in endothelin-1 / Y. Kurihara, H. Kurihara, H. Suzuki, T. Kodama, K. Maemura, R. Nagai, H. Oda, T. Kuwaki, W.H. Cao, N. Kamada, K. Jishage, Y. Ouchi, S. Azuma, Y. Toyoda, T. Ishikawa, M. Kumada, Y. Yazaki // Nature. - 1994. - Vol. 368. - P. 703-710.
  30. Lago-Docampo, M. (2022) Common Variation in EDN1 Regulatory Regions Highlights the Role of PPARγ as a Key Regulator of Endothelin in vitro / M. Lago-Docampo, C. Solarat, L. Méndez-Martínez, A. Baloira, D. Valverde // Front. Cardiovasc. Med. - 2022. - Vol. 9. - P. 823133.
  31. Terenina, E. Time course study of the response to LPS targeting the pig immune gene networks / E. Terenina, V. Sautron, C. Ydier, D. Bazovkina, A. Sevin-Pujol, L. Gress, Y. Lippi, C. Naylies, Y. Billon, L. Liaubet, P. Mormede, N. Villa-Vialaneix // BMC Genomics. - 2017. - Vol. 18. - P. 988.
  32. Coppola, U. Rimbp, a New Marker for the Nervous System of the Tunicate Ciona robusta / U. Coppola, P. Olivo, E. D'Aniello, C. J. Johnson, A. Stolfi, F. Ristoratore // Genes (Basel). - 2020. - Vol. 11. - Issue 9. - P. 1006.
  33. Girotto, G. Expression and replication studies to identify new candidate genes involved in normal hearing function / G. Girotto, D. Vuckovic, A. Buniello, B. Lorente-Cánovas, M. Lewis, P. Gasparini, K.P. Steel // PLoS ONE. - 2014. - Vol. 9. - P. e85352.
  34. Okuda, H. LRGUK1 is part of a multiprotein complex required for manchette function and male fertility / H. Okuda, K. DeBoer, A. E. O’Connor, D. J. Merriner, D. Jamsai, M. K. O’Bryan // FASEB J. - 2017. - Vol. 31. - P. 1141-1152.

Авторы:

  1. Решетникова Анастасия Александровна, мл. науч. сотрудник, ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста».
  2. Белоус Анна Александровна, канд. биол. наук, ст. науч. сотрудник, ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста».